Overview

O papel do vírus do papiloma humano (HPV) como potencial fator etiológico do carcinoma oral (CO) tem sido debatido nas últimas três décadas. A patogénese do HPV no cancro do colo do útero está bem estabelecida e a Agência Internacional de Investigação do Cancro aceitou o papel do HPV em vários cancros da cabeça e do pescoço. No entanto, as provas de uma ligação definitiva entre o HPV e o CO continuam a ser controversas. A genotipagem baseada em sequências (SBG) oferece aos utilizadores várias vantagens, incluindo um método genérico de preparação de amostras, uma estratégia uniforme de fluxo de trabalho bioinformático para atingir objectivos de genotipagem adaptados a espécies individuais, independentemente da disponibilidade de uma sequência de referência, a caraterística mais distintiva é a capacidade de genotipar qualquer estrutura populacional, independentemente de os dados parentais estarem incluídos, e a capacidade de marcar marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) co-dominantes que segregam nas populações.